از آنجا که در موضوع ابلاغیه شماره 1401/540/47537 آمده است: "معرفی متخلفین احتمالی نهاده های کشاورزی و دامی با ارز ترجیحی به مراجع قضایی به استناد دستورالعمل قبلی"، بسیاری از شرکت های وارد کننده نهاده های دامی در بعضی از استان ها دچار مشکل شده اند و طبق این دستورالعمل ابلاغی با آن ها برخورد شده است، در حالی که ارز مورد استفاده آن ها جهت واردات ارز 4200 تومانی نمی باشد زیرا ارز واردات نهاده های دامی ارز نیمایی می باشد، اتحادیه واردکنندگان نهاده های دام و طیور ایران طی نامه شماره 1773 مورخ 1401/08/18 به دکتر ساداتی نژاد وزیر محترم جهاد کشاورزی (با رونوشت به دبیرخانه کمیته حمایت از کسب و کار) خواستار رسیدگی به این موضوع شدند و ابلاغ و اصرار بر اجرای دستورالعمل ابلاغی شماره 1401/540/47537 را مغایر بر تکلیف قانونی مصرح در بند (24) و (30) قانون بهبود مستمر فضای کسب و کار ابلاغی طی نامه شماره 85230 مورخ 1401/05/22 معاونت محترم حقوقی ریاست جمهوری دانستند. لذا جلسه کارگروه تخصصی در تاریخ 1401/09/23 با حضور اعضای کمیته حمایت از کسب و کار و مدیرکل دفتر بازرسی و نظارت وزارت جهاد کشاورزی جهت بررسی این موضوع برگزار شد در نهایت با توجه به آنچه در این جلسه عنوان شد، بازنگری و اصلاح ابلاغیه دفتر بازرسی وزارت جهاد کشاورزی در دستورکار قرار گرفت و مقرر شد این موضوع در چارچوب جلسه‌ای در دفتر بازرسی و نظارت وزارت جهاد کشاورزی با مشارکت اتحادیه واردکنندگان نهاده های دام و طیور انجام شود و پیشنهاد شد بخش حقوقی دستگاه‌ها در تهیه دستورالعمل‌ها و ابلاغیه‌ها مشارکت کنند تا از تدوین متون مبهم جلوگیری شود. همچنین مقرر شد انجمن واردکنندگان نهاده های دام و طیور لیست موردی شرکت های واردکننده نهاده با ارز نیمایی که در برخی از استان ها به دلیل برداشت اشتباه از ابلاغیه دچار مشکل شده اند را به سازمان تعزیرات حکومتی و وزارت جهاد کشاورزی جهت بررسی و انجام اقدام لازم اعلام نماید.
در تاریخ 1401/11/26 اتحادیه وارد کنندگان نهاده های دام و طیور ایران طی نامه شماره 1894 اعلام کرد موضوع با هماهنگی و مساعدت دفتر تخصصی در وزارت جهاد کشاورزی و اعلام به واحدهای اجرایی مرتفع گردیده است.